不知道你有没有看前面柯南用手机试探黑衣组织成员的那集。柯南本身有两部手机、一部是作为柯南联系别人、一部是作为新一联系别人。在试探黑衣组织成员的过程中柯南本身的手机上便得到了该成员的指纹、而赤井秀一后来从柯南手中拿过得是作为新一的手机、事后朱蒂在警局作指纹检测的手机便是作为柯南的那部手机、也就是说检测的指纹是组织成员的、也就是秀一让组织成员代替了自己、从而让自己脱身。