一个机构两块牌子是指同一个机构，同时具有两个名称，对外表现为两种身份。

按照中央机构编制委员会办公室的解释：所谓“一个机构”，就是一个法人代表、一个财务帐号、一套领导班子和一个队伍；所谓“两块牌子”，就是指一个机构有两个名称，根据工作需要，以不同的名义对外使用相应的名称。“一个机构多块牌子”的出现大多数因为党政不分、政府代行非政府组织职权。

产生原因

“一个机构两块牌子”的现象，一个主要方面是产生于中国目前的党政关系。因为中国由中国共产党领导，又由于党政分离的行政改革需要，担负着国家部门职权的党内部门有时就需要以国家名义行政，这样同样一套内设机构和领导班子，在党和国家的不同场合就挂上不同的牌子，成为“一个机构两块牌子”。

这种情况最为典型的，表现在部分党中央和国家层面的机构中。例如，中华人民共和国中央军事委员会和中国共产党中央军事委员会。

其他党和国家层面机构存在或曾经存在“一个机构两块牌子”的，还有国务院新闻办公室与中央对外宣传办公室，国务院台湾事务办公室与中央台湾工作办公室，国家档案局与中央档案馆，国家保密局与中央保密委员会办公室，国家密码管理局与中央密码工作领导小组办公室。

以上内容参考：百度百科-一个机构两块牌子