西南大学有三个校区。

校本部

又名为主校区或北碚校区，位于重庆市北碚区，这里住着博士后、博士硕士研究生、本科第一批及提前批次学生、少数民族预科生和留学生，可划分为北区和南区，在校生近5万人（其中博士、硕士研究生11000余人，本科学生30000余人），占地面积9630余亩，建筑面积约166万平方米。

荣昌校区

荣昌校区前身为四川畜牧兽医学院，位于重庆市荣昌区[ ，2015年起招收本科第一批次，全日制在校本科学生4500余人、硕士研究生200余人，网络和继续教育学生2800余人。常驻校区在职教职工近500人，其中教授、副教授150人；具有博士、硕士学位195人；国家高等教育教学指导委员、国务院特殊津贴专家、农业部兽药审评委员、重庆市学术带头人、突出贡献专家等30余人；研究生导师80人 。（数据截止至2015年3月）

江北校区

江北校区即应用技术学院。西南大学应用技术学院位于重庆市渝北区红石支路500号（龙溪街道），是西南大学从事全日制应用技术本科教育的学院，是西南大学下属的32个二级学院之一。学院位于重庆市渝北区龙溪街道红石支路500号，毗邻重庆市区。学院设有七个本科专业，仅在重庆市内招生，其录取分数线为二本控制线，最高分超过重本线。