增值税专用发票和普通发票都是税务机关监制管理的发票，但二者在多方面存在差异，主要区别有四个方面：

1、含义不同增值税专用发票，既作为纳税人反映经济活动中的重要会计凭证，又是兼记销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明，是增值税计算和管理中重要的决定性的合法的专用发票。

普通发票是指在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的收付款凭证。

2、发票使用主体不同增值税专用发票一般只限于增值税一般纳税人领购使用。

普通发票主要由营业税纳税人和增值税小规模纳税人使用。

增值税一般纳税人在不能开具专用发票的情况下也可使用普通发票。个别情况下小规模纳税人可以通过税务机关代开专用发票。

3、发票组成不同增值税专用发票由基本联次或者基本联次附加其他联次构成，基本联次为三联：记账联、抵扣联、发票联。

普通发票由行业发票和专用发票组成。行业发票适用于某个行业和经营业务，专业发票仅适用于某一经营项目。

4、发票作用不同增值税专用发票是商事凭证，由于实行凭发票购进税款扣税，购货方要向销货方支付增值税，因此也是完税凭证，起到销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明的作用。

而普通发票除运费、收购农副产品、废旧物资等可按法定税率用作抵扣外，其他的一律不予作抵扣用。

开发票时为什么要缴税？由于发票是取得经营收入的一种证明，开了发票，就意味着纳税人取得了收入。而我们的多个税种，主要是流转税，都是在纳税人取得经营收入时征收，所以就使得发票的开具使用和税收的征收紧密联系在一起。开发票缴税，变成一种常见现象。

当这种习惯为大家接受后，一些本来不应该在开具发票环节征收的其他税种，也纷纷把征收环节转移到开发票的时刻，采取附征的方式，以免税收流失。比如，开具发票时附征的个人所得税，就是一个典型案例。