第一，黑暗组织的大boss是谁？

第二，贝姐有没有吃下aptx4869？她是大boss的谁？她和安室到底是什么关系？她为什么非要杀死灰原不可？

第三，柯南什么时候能变回新一，变回去的时候用什么方法，变回来的时候会不会告诉其他人我曾经是柯南？

第四，毛利小五郎是不是装傻？

第五，柯南为什么会被世良那一家子叫做魔术师？

第六，朗姆是谁？

第七，浅香是谁？

第八，秀吉的义兄羽田浩司为什么会被黑暗组织弄死？

第九，领域外的妹妹（世良，秀吉，秀一的妈妈）真正的身份是什么？

第十，世良他们只是见过小时候的新一，为什么新一变小之后小兰都没有认出来世良一出现就知道柯南就是新一？

第十一，灰原当年跟黑暗组织去鱼人岛到底干了什么？

第十二，灰原当年在竞技场看着柯南心里想着的那句你已经卷进了组织半个世纪前的事件到底是什么意思？

第十三，APTX4869这个药真正的用途到底是什么？（贝尔摩德曾经对板仓卓说过 我们既是上帝也是恶魔。因为我们要逆转时间的洪流，让死人复生）这段话让人感觉又有故事

第十四，灰原跟琴酒到底有什么过去？（主要琴酒想到灰原的时候都是光着的让人不得不误会哈哈）

第十五，波本跟贝姐之间到底有什么约定？

第十六，波本跟灰原的妈妈有什么关系？

第十七，若狭留美真正的身份是什么？（漫画新出人物朗姆候选人）

第十九，黑田卫兵（现警卫厅管理官朗姆候选人）

第二十，胁田兼则（漫画新出人物，朗姆候选人）

暂时就想到这些，有些坑漫画上已经填好了只不过还没有做成动画，我说的这些都是还没有填的坑，前几个坑如果填完了也该大结局了