洛克人X3：

21XX年，科学家机器人「多普拉博士」一举扫荡了所有的异常者。

之后，多普拉在他所建造的和平城市「多普拉城」，集结了许多优秀的机器人。

之后又过了几个月…

本来应该已经镇静化的异常者们，竟然同时发动叛乱。

为了查明主谋者是不是就是多普拉博士，异常者猎人总部命令艾克斯和杰洛追捕多普拉博士，并消灭多普拉军。

异常者猎人艾克斯与杰洛，出动！！

数小时后，从异常者猎人总部传来了紧急通讯。

这里是异常者猎人总部！

我们受到多普拉军的攻击，现在正在应战中！

在总部周边的异常者猎人请尽快回来，并且即刻应战

洛克人X4：

西元21XX年，拥有人类思考能力的雷普利机器人和人类和平生存着

在现今有两个大型组织，分别为处理异常者的雷普利机器人组织「异常者猎人」，以及为了应对大规模灾害可迅速处理，以雷普利机器人组成的军队「改造军团」

这两者到目前为止都是以合作方式执行各种任务以维持和平

但一天，改造军团突然发动武装叛变，并占据世界各地

异常者猎人司令部便把所有的改造军团的人员认定为异常者，命令艾克斯与杰洛出击

为何改造军团要叛变呢？

在这战争之中他们所追求的究竟是...？