疾控中心和医院是完全不同的性质和单位，所行使的权力和工作职责不一样。

双方技术含量各有不同，医学主要是救死扶伤，治病救人，而疾控中心对疾病残疾和伤害的控制。

疾病预防控制中心（简称：疾控中心）：其使命是通过对疾病、残疾和伤害的预防控制，创造健康环境，维护社会稳定，保障国家安全，促进人民健康；其宗旨是以科研为依托、以人才为根本、以疾控为中心。

疾病预防控制中心是由政府举办的实施国家级疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位。

疾控中心管理职责中加强公共职能，比如对传染病传播的预判职能要加强，通过互联网大数据平台及周边地区传染源及发病率的变化，通过微信或手机短信等渠道提前给人们发出警示信息。

县级以上疾病预防控制机构应当协助卫生行政部门和有关部门对事故现场进行卫生处理，并对与食品安全事故有关的因素开展流行病学调查。

而医院主要各部门的职能主要职能：

⑴ 根据“医疗机构管理条例”和党的方针政策全面领导医院的工作，促进医院发展。包括医疗、教学、科研、预防、人事、财务和总务等工作，侧重负责医院财务、人事、院办工作。

⑵ 领导制定本院发展规划及年度工作计划，按期布置、检查、总结工作，并向领导机关汇报。

⑶ 负责组织、检查医疗护理工作，定期深入门诊、病房，并采取积极有效措施，保证不断地提高医疗质量。

⑷ 负责组织、检查临床教学、培养干部和业务技术学习。

⑸ 负责领导、检查全院医学科学研究工作计划的拟订和贯彻执行情况，采取措施，促进研究工作的开展。

⑹ 负责组织、检查本院担负的分级分工医疗工作的地段工作。

⑺ 教育职工树立全心全意为人民服务的思想和良好的医德。改进医疗工作和工作作风，改善服务态度。督促检查以岗位责任制为中心的规章制度和技术操作规程的执行。严防差错事故的发生。