深圳目前有罗湖火车站(深圳火车站)、深圳火车西站、深圳火车东站、深圳北站(高铁站)、福田火车站(高铁站)、坪山火车站(高铁站)。

罗湖火车站位于深圳市罗湖区建设路1008号，地处市中心城区，紧靠罗湖口岸，是广深铁路的南端起点。地铁1号线罗湖地铁站直达。

深圳火车站西站亦称南头火车站、南头火车西站，深圳市南山区南山街道月亮湾大道。在平南铁路线（平湖——南头）上，南部延伸至蛇口妈湾港。

深圳东站，前身布吉火车站位于深圳市龙岗区布吉街道。地铁3号线、5号线（布吉站）

深圳北站位于深圳市宝安区龙华新区民治街道，地铁4号线、5号线（深圳北站）。

福田火车位于福田高铁站位于益田路与深南大道相交处，是目前国内第一座位于城市中心区的全地下火车站。是广深港高铁的重要站点，福田火车直达香港只须15分钟。也是深圳的重要的综合交通枢纽，包含地铁2、3、11号线。

深圳坪山火车站站位于深圳市龙岗区丹梓西路，为厦深铁路上的一个客运二等站。